執(zhí)業(yè)藥師和主管藥師分屬不同的系統(tǒng)，執(zhí)業(yè)藥師屬于藥監(jiān)系統(tǒng)，主管藥師屬于衛(wèi)生系統(tǒng)，執(zhí)業(yè)藥師不可以轉(zhuǎn)為主管藥師，但是取得執(zhí)業(yè)藥師資格證書的人員可以直接評中級職稱。

執(zhí)業(yè)藥師由藥監(jiān)局認可。國家藥品監(jiān)督管理局辦公室與人力資源社會保障部辦公廳聯(lián)合發(fā)布了《關于征求執(zhí)業(yè)藥師職業(yè)資格制度規(guī)定和資格考試實施辦法兩個征求意見稿意見的通知》藥監(jiān)辦函〔2018〕165號，專業(yè)技術人員取得執(zhí)業(yè)藥師職業(yè)資格，可認定其具備主管藥師或主管中藥師職稱，并可作為申報高一級職稱的條件，所在單位根據(jù)工作需要可聘任執(zhí)業(yè)藥師為主管藥師或主管中藥師專業(yè)技術職務，這是單位在工作職務中的認可評級，與衛(wèi)生部認可評定的主管藥師職稱是不一樣的。